Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms