Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gabpb2P81069 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms