Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn1P70268 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn1P70268 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Pkn1P70268 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn1P70268 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn1P70268 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn1P70268 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn1P70268 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkn1P70268 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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