Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfixP70257 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfixP70257 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfixP70257 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfixP70257 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms