Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chl1P70232 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chl1P70232 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chl1P70232 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms