Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crnkl1P63154 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms