Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tra2bP62996 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms