Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms