Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms