Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms