Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms