Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms