Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtnsP57757 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms