Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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