Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nub1P54729 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms