Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms