Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map3k1P53349 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Map3k1P53349 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms