Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgd1P52734 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms