Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbrP50284 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms