Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms