Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms