Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms