Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gli1P47806 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gli1P47806 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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