Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms