Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms