Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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