Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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