Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprkP35822 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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