Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc5P35689 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms