Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sftpa1P35242 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms