Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar1P33896 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms