Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms