Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RxraP28700 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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