Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb7P26011 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb7P26011 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms