Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms