Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms