Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms