Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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