Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms