Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcer1aP20489 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fcer1aP20489 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fcer1aP20489 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fcer1aP20489 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms