Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TP20293 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TP20293 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TP20293 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TP20293 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TP20293 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TP20293 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TP20293 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TP20293 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TP20293 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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