Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms