Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18528 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P18528 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
P18528 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18528 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms