Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18526 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18526 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18526 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms