Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms