Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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