Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RhoP15409 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms