Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms