Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms