Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P10404 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P10404 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P10404 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms